Vuonna 1818 perustettu Prahan kansallismuseo on yksi maailman suurimmista ja suosituimmista museoista. Se sijaitsee kauniissa uusrenessanssityylisessä-rakennuksessa, jonka on suunnitellut Josef Schulz. Rakennus sijaitsee Wenceslas-aukion yläpäässä. Sen vaikuttava etujulkisivu ilmentää Tšekin tasavallan symboliikkaa.
Rakennus on koti 14 miljoonalle esineelle. Sillä on historiallinen haara ja luonnonhistoriallinen siipi. Historian haara keskittyy esihistoriaan, Tšekin historiaan ja teatteriin. Luonnonhistoriallinen siipi esittelee eläintiedettä, paleontologiaa, kasvitiedettä ja mineralogiaa. Täällä sijaitsevat myös antropologian ja numismatiikan haarat.
Museon ensimmäinen rakennus oli Sternbergin palatsi, joka sijaitsee aivan Prahan linnan pääsisäänkäynnin ulkopuolella. Se oli ensimmäinen paikka, jossa Royal Bohemian Collection sijaitsi. Kaspar Maria Sternberg toimi museon ensimmäisenä operaattorina ja Isänmaallisen museon seuran ensimmäisenä puheenjohtajana. Museon kokoelma laajeni 1900-luvun alkuun mennessä. Myöhemmin se siirrettiin Nostik-palatsiin Na Prikopeen.
Museon alkuvuosina painopiste oli luonnontieteissä. Tämä johtui Itävallan keisari Joseph II:n luonnontieteellisestä näkökulmasta. Museon varhaiset johtajat yrittivät tasapainottaa historiaa ja luonnontieteitä. He kirjoittivat vuoden 1841 traktaatin, jossa hahmoteltiin heidän museofilosofiaansa.
Kansallismuseon rakennus vaurioitui ilmapommeista vuonna 1945 ja Neuvostoliiton armeijan ajoneuvoista Prahan kansannousun aikana vuonna 1968. Lisäksi rakennus vaurioitui. kärsi liiallisesta melutasosta ja vaarallisen korkeista pölytasoista. Vuonna 1968 etujulkisivu vaurioitui Neuvostoliiton konekivääritulissa. Jälleenrakennus valmistui vuosina 1970–1972.
Kansallismuseo on ollut suljettuna jälleenrakennustöiden vuoksi vuodesta 2011 lähtien. Sen piti avata uudelleen 28. lokakuuta 2018 Tšekkoslovakian itsenäisyyden 100-vuotispäivänä. Se oli Tšekin historian suurin museokokoelmien siirto. Remontin aikana museorakennus rakennettiin uudelleen ja julkisivu uusittiin. Sitten se yhdistettiin uuteen maanalaiseen käytävään. Rakennus kärsi myös jatkuvasta raskaan tieliikenteen tärinästä. Museon johto ei kuitenkaan halunnut tinkiä sen alkuperäisestä ulkonäöstä. Ne suurensivat alkuperäistä aluetta 30 prosentilla.
Yksi kansallismuseon näkyvimmistä näyttelyistä on Prahan Langweil-malli. Tämän mallin rakensi Antonin Langweil varhain. 1830-luvulta ja on pitkälti valmis. Se oli kuitenkin epätäydellinen hänen kuollessaan.
Rakenuksen julkisivussa on myös allegorinen veistosryhmä, joka todistaa Tšekin maiden yhtenäisyydestä. Museon korkea kupoli sisältää 72 valoa, jotka edustavat tšekkiläistä kulttuuria. Rakennusta pidetään yhtenä Prahan vierailluimmista kohteista. Museossa on myös tšekkiläinen ulkoravintola. Se on suosittu kulttuurin ja historian ystävien keskuudessa.
Museo on myös Tšekin historian museon kotipaikka. Historian haara on jaettu useisiin osiin, ja se keskittyy suurelta osin esihistoriaan, Tšekin historiaan ja numismatiikkaan. Se on hyvä paikka ottaa lapset mukaan. Siellä on myös perheohjelmia. Museo on ilmainen kuun ensimmäisenä maanantaina. Museossa on myös ainutlaatuinen kirjasto. Kirjastossa on noin kahdeksan tuhatta korvaamatonta antiikin käsikirjoitusta ja harvinaisia kirjapainoksia.